En el marco del proyecto UTA – UC-Davis Chile, la Facultad de Ciencias Agronómicas invita a los investigadores, profesionales y estudiantes al primerr curso de Bioinformática: “Análisis del gen 16S rRNA para estudiar comunidades bacterianas”, que se desarrollará en el auditorio de la Facultad de Ciencias Agronómicas entre el 23 al 25 de mayo de 2017.
El curso tiene por objetivo proporcionar conceptos y habilidades prácticas a estudiantes e investigadores sin conocimiento técnico en bioinformática, que deseen lograr independencia para diseñar y realizar experimentos y analizar datos genómicos de secuenciamiento masivo.
El curso lo dictará el Dr. Eduardo Castro, del Centro de Bioinformática y Biología Integrativa de la Universidad Andrés Bello e incluirá los siguientes contenidos:
Primer Día:
Teoría: Secuenciamiento masivo de DNA total y productos de PCR. Taxonomic and functional profiling y metabarcoding.
Práctica: Preparando el computador: Introducción a la terminal, Bash, R/RStudio, y Bioconductor
Segundo Día:
Teoría: ¿Por qué el 16S rRNA? Ventajas, limitaciones y estrategias de análisis (¿Qué podemos responder?)
Práctica: Introducción a mothur, SILVA y GreenGenes
Tercer Día:
Teoría: Diseño experimental, poder estadístico, análisis de datos
Práctica: Diversidad alfa y beta, métodos de distancia y escalamiento multidimensional, análisis de abundancia diferencial, y redes de co-ocurrencia
Consultas e inscripción: Dr. Wilson Huanca-Mamani, e-mail: whuanca@uta.cl; Iris Hurtado C., e-mail: ihurtadoc@uta.cl
